Договаривайтесь. Это менее проблемный путь, обсуждайте сумму отступных, если по Вашему мнению она завышена. Даже если домен принадлежит Вам, и Вы смените пароли от админки, то чтобы идти на конфликт Вам понадобятся очень хорошие знания по настройке сервера, (например запрет просмотра директорий, безошибочное выставление прав на файлы и директории и т.д.). Будучи разработчиком, человек чётко представляет как работает ваш сайт. Даже используя надёжную cms (в плане безопасности), надёжность падает пропорционально количеству установленных сторонних расширений, модулей и плагинов. Зачастую в таких проектах используются самописные решения заточенные под конкретные нужды. Большая вероятность, что запрет доступа в админку не защитит Вас. Идя на конфликт Вы должны понимать, что с очень большой вероятностью, работоспособность сайта будет нарушена. Я вижу 2 решения 1) вы договоритесь 2) вы создадите новый магазин.