Здравствуйте!
Домен "сайт.ру" в индексе Гугла имеет 2% страниц не под фильтрами. А с префиксом "www.сайт.ру" имеет 59% страниц не под фильтрами. Оба варианта добавлены в панель вебмастера Гугл. 

Подскажите, нужно ли определить основной домен в Гугле с префиксом www. или оставлять как есть. Индексация одинаковая. 

В Яндексе у меня главным определен "сайт.ру" без префикса www. Не скажется ли негативно на продвижении сайта разное определение главных доменов в Поисковых системах.