Светлана пишет:

Цитата
У одной компании есть два сайта

Должна быть либо разная тематика, либо разделение по продвигаемым запросам, хотя и относящимся к одной теме. В целом, продвижение одной компании по двум сайтам нежелательно.

Цитата
Как подбирать ключевые слова

Ключевые слова и запросы можно формировать для каждой страницы отдельно. Желательно составление СЯ. Если таки два сайта и это будет и дальше, то делается одно СЯ и, в зависимости от контента, делится на два. Затем по каждой половинке для каждого сайта статьи оптимизируются под слова и запросы своих половинок.

Имхо.