Расскажу вкратце:

Создавал сайт kinoscrub.ru не делая упор в СЕО - на javascript. Подгрузка данных, переходы, фильтр - все на джава скрипте, все для юзверя. В итоге сайт готов - а в индекс попадает только главная страница.

Переход по страницам осуществлялся через джаваскрипт - подгрузкой в див следующей страницы:

Код
<a href="#" onclick="navigatefilms(2);">Далее</a>

Решил добавить ссылки "под" событие онклик, тем самым без поддержки джаваскрипт - сайт стал бы работать только на ссылках (ну и индексироваться):

Код
<a href="index.php?page=2" onclick="navigatefilms(2); return false;">Далее</a>

Грешу только на это.
robots.txt для всех общий, все что нужно - разрешено. При анализе через cy-pr показывает 1 страницу по яндексу .

Есть идеи?