У меня такая же беда...
Недавно прогнал ссылки по твиттеру.. хорошим аккаунтам.. но они не попали в индекс..причем ни одна! (и прогоншик очень сильно удивился.. т.к. это редкость) Причем новые новости вообще не попадают в индекс последнее время.. после 10.03 числа.. я проверял и на других крупных сайтах , там так же.. , но и на других сайтах (конкурентах) , быстробот хорошо себя чувствует.. может работы какие у яндекса.. но уже прошло не мало время.. нужно что-то делать.. 

В день добавляю 10-15 новостей уник.. 
Текст на сайте уникальный 90% примерно.. я думаю этого достаточно..  

На многих моих страницах , после проверки пишет "Адрес страницы уже известен роботу, но в данный момент контент страницы ещё не проиндексирован. 
" Я так понимаю , робот заглянул в неё , но в индексировать и добавлять в поиск не хочет. 

Я уже не один месяц пытаюсь понять в чем дело.. но ничего не могу..((  как я вижу , я не один такой..