Не понимаю в чём дело, добавил сайт в гугл и яндекс, гугл всё нормально проиндексировал, но яндекс..

А Яндекс проиндексировал всего 12 страниц, причём эти 12 страниц шли вместе с шаблоном, то есть страницы, которые были с самого появления шаблона. Яндекс проиндексировал только то, что было ещё 3 месяца назад, и никакие другие изменения в сайте он не нашёл. Даже название главной страницы "Демонстрационная страница движка DataLife Engine" не изменилась, хотя сейчас стоит совершенно другое название (уже месяца полтора так).