1. Отдельные шаблоны рубрик я стараюсь не использовать, поскольку, в случае каких-либо изменений верстки и пр. зачастую приходится править каждый из них. Кроме того, если рубрик станет больше, прийдется делать еще шаблоны и пр.
2. На счет сайдбара, я бы вставлял виджеты в зависимости от рубрик. К примеру, что-то типа такого:

Код
if (is_category(1)) {     dynamic_sidebar('widgets-1'); } elseif  (is_category(2)) {     dynamic_sidebar('widgets-2'); } else {     dynamic_sidebar('widgets-3'); }

3. Кроме того, есть плагины, позволяющие выводить виджеты в зависимости от определенных условий (страница, рубрика и пр.) http://wordpress.org/plugins/tags/conditional-tags Но чем больше плагинов, тем большая вероятность разнообразных проблем.