Всем спасибо. Пробовал все. Восстанавливал резервные копии, все возвращалось на место. Пошукал интернет, проблем таких было несколько штук, написали что это SQL иньекция в базу данных. Решил сменить хостинг, т.к. такие проблемы не первый раз, за 2,5 года это уже 4 раз (взлом). На другом хостинге восстанавливал один сайт, все работает и ничего не изменяется, но брал резервную копию за два дня до взлома, отследил по посещаемости, т.к. она упала в 10 раз.

И тогда еще один вопрос: Как восстановить базу данных MYSQL которая весит от 400 Мб и 1Гб? phpMyAdmin  разрешает только 50 Мб.

Еще раз всем спасибо.