Был полностью переделан старый сайт. Все ссылки меню и разделов, внутренние ссылки, сделаны без префикса www. Однако все внешние ссылки и главное зеркало у Яндекса и Гугла определены с www. так как раньше вся внутрення структура сайта была с префиксом www.

Что лучше - оставлять все как есть, и прогонять сайт по бэкам с www. Или делать редерикты, смены зеркал в Яндексе и Гугле на site.ru. ?

Тогда Яндекс все старые ссылки с www. не будет учитывать?