SERP Parser пользуюсь данной программой, она платная, очень гибкие и удобные настройки

Рекомендую Majento PositionMeter (бесплатный)

Пользуюсь этим сервисом - http://goo.gl/NDxfqC
Он платный, но очень недорогой. Очень удобный тем, что можно снимать позиции сразу в 2 поисковых системах, причем выбирать регион. Каждые сутки позиции снимаются автоматически в заданное время, а также можно снять вручную. Вроде не глючит и позиции снимает достаточно правильно, выводит графики по отдельно взятой позиции, а также по группе позиций. В общем мне нравится. Попробуйте, что ли

Top Inspector - самый дешевый из всех, которые попадались, позиции показывает точно.

Мой взгляд о лучшем сервисе проверки позиций сайта 

Смотрю _http://www.seogadget.ru/serppos_ 30 позиций в один заход, яшка гугл, регионы, конкуренты.

Цитата

sipovets пишет: Я очень не советую пользоваться Sitexpert-ом. Поначалу сервис мне нравился, но потом начал безбожно врать. Позиции различаются на 50+. Техподдержка отвратительная. Я уже не говорю о том, что они не здороваются, они не хотят вникать в твою проблему. Отвечают: "такую выдачу нам дает Яндекс", а то, что результат неверный - их не волнует. Сравнивала выдачу с другими сервисами, там все определяется корректно. В общем сейчас у меня на акаунте почти 1 000 рублей зависла, вывести их не могу и тратить смысла нет. Проанализировала уже с 10-к разных сервисов, пока склоняюсь к ya-bot.net в нем очень простой и понятый интерфейс и хорошо настроена работа с регионами.

Sipovets, к сожалению некоторое время сервис действительно был в стагнации - описанные вами проблемы имели место быть.
В настоящее время идет работа над перезапуском проекта. Работает целая команда, в составе есть выделенный SEO-шник - как гарантия развития проекта и добавления таких SEO инструментов которых сейчас нет ни у кого. 

— Разработан новый свежий дизайн ориентированный на простоту и удобство пользователей — удобство тестировали на людях не знакомых с СЕО вообще, каждый из них без проблем освоил работу с проектом\ключевыми словами\и.т.п. В настоящее время идет верстка нового дизайна.

— Правится алгоритм снятия позиций, больше никаких расхождений в позициях.

— Разработан и будет включен на релизе новый тариф по 0.001$ за 1 проверку КС в одной поисковой системе в пределах топ 100. Вкупе с возможностью выставить проверку раз в N дней - это действительно один из самых выгодных тарифов на сегодняшний день. Для удобства пользователей разрабатвается калькулятор тарифов.

— Бесплатный вариант пользования сервисом с ограничение в 10 проверок в день для оценки качества пользования сервисом.

— Разрабатываются действительно полезные SEO инструменты, не для галочки аля тиц\пр, а инструменты аналоги которых есть только в сео компаниях для внутреннего пользования. Интересно? Следите за новостями! 

— Мы открыты для новых идей, вы всегда можете прислать нам на почту свои "хотелки" и если большинство пользователей проголосует за новую фичу - мы ее реализуем.

— Все кто уже зарегистрированы — ждите email рассылки, именно с ее помощью мы оповестим всех наших клиентов о перезапуске сервиса.

Ориентировочное время перезапуска — февраль 2015 года.