Лучшая мобильная версия - адаптивный дизайн, а значит далеко не критерий при выборе CMS. В крайнем случае, если нужны 2 варианта - это решается, в большинстве cms правки не большие. Куда важнее скорость работы + что будет идти "из коробки" (поиск, фильтры и прочие полезности) + возможности для SEO (ЧПУ, метатеги, минимум дублей страниц и т.п.) + наличие дополнений + удобство администрирования (то же важно).. Я бы рекомендовал Opencart, но нужно помнить - ничто массовое готовое не идеально для конкретного случая, без сторонних дополнений обходится редко.