1. именно на затруднение продвижения особого влияние счетчики не оказывают, если конечно у вас их не большая куча, как сказано выше закрывать ноиндекс нофоллоу нужно обязательно, только я не понял следующей фразы: 

Цитата
kosa1 пишет: вы полочуете жирный тег с каталога счетчика

2.  если не закрывать тегами, то показатели сайта (тиц и пр) будут частично переданы рейтингу или каталогу, смотря чей счетчик будет установлен. а если и тематика схожая с тематикой хозяина счетчика то и вес передан будет существенный.у одного товарища видел на сайте счетчик ливе который был не кликабельным тобиш не передавал никакого веса, а посетителей подсчитывал, так что можно поэкспериментировать и с изменением кода...