При условии соблюдения всех правил по 301му редиректу, проблем возникнуть не должно, разве что кратковременные.

Я было что менял домен и сразу url делал с ЧПУ, настраивал на все это редирект и норм, месяц-два и все восстановилось.

п.с. Но если бы был такой выбор, как у вас, я бы ничего не менял.